Akşit, Hüseyin; Şimşek, Samed; Akşit, Zeynep; Atahan, Alparslan; Musatat, Ahmad Badreddin; Albayrak, Esra Nur

Eight novel 2,4,6-triarylpyridines derived from syringaldehyde were designed and synthesized via a multicomponent one-step preparation method. Those compounds were evaluated for their antioxidant activities comparing with known reference compounds. In the studied series, toluyl, methoxyphenyl, and pyridinyl-bearing derivatives exhibited considerable antioxidant activities. Meanwhile, using the B3LYP theory and SVP, TZVP basis sets, a comprehensive theoretical quantum computing approach for the synthesized compounds was established and electronic structure descriptive parameters called Fukui indices describing the radical scavenging potential were determined. Finally, the structure-activity relationship was revealed by comparing the theoretical and experimental outputs. As a result, the potential antioxidant activity of the studied compounds was also supported by a theoretical approach.

Akoğuz, Harun

Günümüzde zeminlerin iyileştirilmesi için birçok farklı metot kullanılmaktadır. Bu metotların birçoğu çevreye zararlı bileşenler içerdiğinden alternatif zemin iyileştirme yöntemlerine ihtiyaç duyulmaktadır. Bu kapsamda zemin iyileştirme yöntemlerine çevreci bir yaklaşım olarak ortaya çıkan Mikrobiyal Aracılı Kalsit Çökelmesi (MICP) tekniği ile zeminlerin mühendislik özellikleri iyileştirilebilmektedir. Ancak MICP tekniği ile zeminlerin iyileştirilmesinde karşılaşılan problemlerden biri uygulama süresidir. Uygulama süresi genelde oldukça fazla olan MICP tekniği için farklı uygulamalara ihtiyaç duyulduğu anlaşılmaktadır. Bu amaçla çalışmamızda çimentolama solüsyonuna (kalsiyum klorür) ilave edildiğinde uygulama süresini azaltabilecek bir biyopolimer türü olan sodyum aljinatın enjeksiyon özellikleri incelenmiştir. Farklı yoğunluklarda hazırlanan sodyum aljinat solüsyonu zemine enjeksiyon yöntemiyle verilerek zemin içerisindeki dağılımı uygulama süresince takip edilmiş ve sonuçlar permeabilite deneyi ve Taramalı Elektron Mikroskobu (SEM) analizi ile değerlendirilmiştir. Sonuç olarak çimentolama solüsyonuna ilaveten sodyum aljinat kullanımının tüm yoğunluklarda (0.1 g/l, 0.3 g/l, 0.6 g/l) permeabilite üzerinde olumlu sonuçları olmuştur. Daha düşük yoğunluklarda ise (0.1 g/l) uygulama süresi biraz daha artmış ancak daha iyi geçirimlilik sonuçlarıyla beraber daha homojen bir dağılım elde edilebilmiştir. SEM analizleri sonucunda oluşan jel yapının taneler arasında bağ oluşturduğu gözlemlenmiştir. MICP tekniği ile zeminlerin iyileştirmesinde düşük yoğunluklarda (en fazla 0.1 g/l) sodyum aljinat kullanımının uygulama süresine olumlu etkisinin olabileceği değerlendirilmiştir.

Özerkan, Dilşad; Danışman, Ferdane; Tüzemen, Nacı

Kolon kanseri, tüm dünyada yaygın olan ve yüksek oranda ölümcül bir kanser tipidir. Tüm kanserlerde olduğu gibi kolon kanserinin seyrinin izlenmesi kritik bir öneme sahiptir. 5-Florourasil (5-FU) kolon kanserlerinde sıklıkla kullanılan bir antikanser ilaçtır ve hücre ölümü esnasında hücrelerde bir takım biyokimyasal ve moleküler farklılıklara neden olmaktadır. Bu çalışmada HCT116 ve HT29 kolon kanseri hücreleri 5-FU kemoterapi ilacı ile inkübe edildikten sonra, 5FU’nun hücreler üzerinde oluşturduğu biyokimyasal değişikliğin tespiti için Fourier transform kızılötesi (FTIR) spektroskopisi kullanılmıştır. 5-FU'nun inhibisyon yüzdesinin 50'ye eşit olduğu konsantrasyonu (IC50), MTT yöntemi kullanılarak belirlendi. IC50 değeri saptandıktan sonra FTIR ölçümleri alındı. Buna göre, 5-FU IC50 değeri sırasıyla HCT116 hücreleri için 12,69 µg/ml, HT29 hücreleri için 10,10 µg/ml bulunmuştur. 5-FU’nun sebep olduğu hücre ölümünün göstergeleri olduğu söylenen lipit içeriğindeki artış ile nükleik asit oranı, total hücresel proteinlerin α-sarmal ve β-yaprak ikincil yapıları ve aminoasit kalıntılarının azalması, kollajen konformasyonundaki değişiklikler gibi IR biyobelirteçlerindeki değişiklikler FTIR spektroskopisi ile gösterilmiştir. Sonuç olarak hem ucuz ve hem de hızlı bir yöntem olan FTIR ile kanser hücre ölümünün incelenmesi alternatif bir yöntem olarak kullanılabilir.

Sarıgöl, Metin

Bu çalışmada, Büyük Menderes Havzası’ndaki Menderes Nehri üzerinde yer alan E07A043 Ertuğrul ve D07A115 Yenice Regülatör Girişi Akım Gözlem İstasyonlarına (AGİ) ait günlük ortalama hidrograf verileri kullanılmıştır. Bu veriler Yapay Sinir Ağları Metodu kullanılarak eğitim ve test aşamalarından geçirilmiş, kurulan bu modele 2015 yılındaki taşkın verileri uygulanarak Taşkın Öteleme hesapları yapılmıştır. Elde edilen sonuçlar, hem ölçülmüş değerlerle hem de Yapay Sinir Ağları Metodu sonuçları ile karşılaştırılmıştır. Karşılaştırma analizinde Belirlilik Katsayısı (R2 ), Hataların Ortalama Karekökü (HOK) değerleri hesaplanmıştır. Sonuçta, günlük akım verilerinin uygulandığı Yapay Sinir Ağları Metodu ile yapılan tahmin sonuçlarının oldukça iyi sonuçlar verdiği, bir sonraki yıla ait taşkın öteleme sonuçlarının ise iyi sayılabilecek bir düzeyde olduğu tespit edilmiştir.