Helikobakter pilori'ye karşı etkili olabilecek yeni bileşiklerin tasarımı, sentezi ve biyolojik değerlendirmesi
Özet
Amaç: Bu çalışmada, H. pilori’nin mide ortamında yaşamını sürdürebilmesinde kritik rol oynayan hedeflere yönelik yeni kinolin-sülfonat türevlerinin yapay zekâ destekli olarak tasarlanması, sentezlenmesi ve aktivitelerinin değerlendirilmesi amaçlanmıştır. Materyal ve Metot: Literatürde bildirilen anti-H. pilori bileşiklerden oluşturulan veri setiyle REINVENT 4 ile tasarlanan altı kinolin-sülfonat türevi, O-sülfonilasyon reaksiyonu ile sentezlenmiş ve yapıları spektroskopik yöntemlerle doğrulanmıştır. Bileşiklerin üreaz inhibitör aktiviteleri Jack bean üreaz enzimi kullanılarak Berthelot yöntemi ile belirlenmiştir. Bulgular: Sentezlenen altı bileşikten yalnızca V ve VI numaralı türevler anlamlı üreaz inhibisyonu göstermiştir. En yüksek aktivite IC₅₀ değeri 6.49 mM olarak V numaralı bileşikte belirlenmiş, VI numaralı bileşiğin IC₅₀ değeri ise 16.88 mM olarak bulunmuştur. Pozitif kontrol tiyoürenin IC₅₀ değeri 1.99 mM’dir. Sonuç: Sonuçlar, triflorometil içeren kinolin-sülfonat türevlerinin umut verici antiüreaz aktivite gösterdiğini ve yapay zekâ destekli tasarım yaklaşımının yeni anti-H. pilori adaylarının geliştirilmesinde kullanılabileceğini ortaya koymuştur.
Aim: This study aimed to design, synthesize, and evaluate the activities of novel quinoline-sulfonate derivatives targeting critical biological targets of H. pylori using an artificial intelligence-assisted approach. Material and Method: Six quinoline-sulfonate derivatives designed using REINVENT 4 from literature-reported anti-H. pylori compounds were synthesized via O-sulfonylation and characterized by spectroscopic methods. Their urease inhibitory activities were determined using the Berthelot method against Jack bean urease. Results: Among the six synthesized compounds, only derivatives V and VI exhibited significant urease inhibitory activity. Compound V showed the highest activity with an IC₅₀ value of 6.49 mM, while compound VI displayed an IC₅₀ value of 16.88 mM. The IC₅₀ value of the positive control, thiourea, was determined to be 1.99 mM. Conclusion: The results demonstrated that trifluoromethyl-containing quinoline-sulfonate derivatives possess promising antiurease activity and that artificial intelligence-assisted design approaches may be utilized in the development of novel anti-H. pylori candidates.
Anahtar Kelimeler
Tam Kayıt
| Alan | Değer | Dil |
|---|---|---|
| dc.contributor.advisor | Prof. Dr. Öztekin ALGÜL | |
| dc.contributor.author | Rabia Şeyma Mengi | |
| dc.date.accessioned | 2026-10-20T22:44:19.769255983Z | |
| dc.date.available | 2026-10-20T22:44:19.769255983Z | |
| dc.date.issued | 2026 | |
| dc.description.abstract | Amaç: Bu çalışmada, H. pilori’nin mide ortamında yaşamını sürdürebilmesinde kritik rol oynayan hedeflere yönelik yeni kinolin-sülfonat türevlerinin yapay zekâ destekli olarak tasarlanması, sentezlenmesi ve aktivitelerinin değerlendirilmesi amaçlanmıştır. Materyal ve Metot: Literatürde bildirilen anti-H. pilori bileşiklerden oluşturulan veri setiyle REINVENT 4 ile tasarlanan altı kinolin-sülfonat türevi, O-sülfonilasyon reaksiyonu ile sentezlenmiş ve yapıları spektroskopik yöntemlerle doğrulanmıştır. Bileşiklerin üreaz inhibitör aktiviteleri Jack bean üreaz enzimi kullanılarak Berthelot yöntemi ile belirlenmiştir. Bulgular: Sentezlenen altı bileşikten yalnızca V ve VI numaralı türevler anlamlı üreaz inhibisyonu göstermiştir. En yüksek aktivite IC₅₀ değeri 6.49 mM olarak V numaralı bileşikte belirlenmiş, VI numaralı bileşiğin IC₅₀ değeri ise 16.88 mM olarak bulunmuştur. Pozitif kontrol tiyoürenin IC₅₀ değeri 1.99 mM’dir. Sonuç: Sonuçlar, triflorometil içeren kinolin-sülfonat türevlerinin umut verici antiüreaz aktivite gösterdiğini ve yapay zekâ destekli tasarım yaklaşımının yeni anti-H. pilori adaylarının geliştirilmesinde kullanılabileceğini ortaya koymuştur. | tr |
| dc.description.abstract | Aim: This study aimed to design, synthesize, and evaluate the activities of novel quinoline-sulfonate derivatives targeting critical biological targets of H. pylori using an artificial intelligence-assisted approach. Material and Method: Six quinoline-sulfonate derivatives designed using REINVENT 4 from literature-reported anti-H. pylori compounds were synthesized via O-sulfonylation and characterized by spectroscopic methods. Their urease inhibitory activities were determined using the Berthelot method against Jack bean urease. Results: Among the six synthesized compounds, only derivatives V and VI exhibited significant urease inhibitory activity. Compound V showed the highest activity with an IC₅₀ value of 6.49 mM, while compound VI displayed an IC₅₀ value of 16.88 mM. The IC₅₀ value of the positive control, thiourea, was determined to be 1.99 mM. Conclusion: The results demonstrated that trifluoromethyl-containing quinoline-sulfonate derivatives possess promising antiurease activity and that artificial intelligence-assisted design approaches may be utilized in the development of novel anti-H. pylori candidates. | en |
| dc.identifier.doi | 10.71008/ebyu.thesis.2026.180 | |
| dc.identifier.uri | https://rdlopen.rawdatalibrary.net/r/ebyu/26134 | |
| dc.language.iso | tr | |
| dc.publisher | Erzincan Binali Yıldırım University | |
| dc.rights | info:eu-repo/semantics/closedAccess | |
| dc.subject | Antibiotic Resistance | en |
| dc.subject | Antiurease | en |
| dc.subject | Artificial İntelligence | en |
| dc.subject | Helicobacter pylori | en |
| dc.subject | Hybrid Compounds | en |
| dc.subject | Virulence Factors. | en |
| dc.subject | Antibiyotik Direnci | tr |
| dc.subject | Antiüreaz | tr |
| dc.subject | Helikobakter pilori | tr |
| dc.subject | Hibrit Bileşikler | tr |
| dc.subject | Virülans Faktörleri | tr |
| dc.subject | Yapay Zekâ | tr |
| dc.title | Helikobakter pilori'ye karşı etkili olabilecek yeni bileşiklerin tasarımı, sentezi ve biyolojik değerlendirmesi | tr |
| dc.title | Design, synthesis, and biological evaluation of new compounds effective against Helicobacter pylori | en |
| dc.type | Master Thesis | |
| dspace.entity.type | Publication | |
| rdl.doi.crossref | 2026-07-30 |
