Β-glukanaz Enziminin Pichia pastoris Ekspresyon Sisteminde Hücre Dışı Üretimi ve Saflaştırılması

ArticleAçık Erişim

Özet

Bu çalışmada, Rhizomucor miehei -1,3-1,4-glukanaz geni, Pichia pastoris ekspresyon sisteminde AOX1 promotorunun regülasyonu altında ifade edilmiş ve en yüksek üretim seviyesini sağlayan klon belirlenmiştir. Kodon optimize edilmiş gen, pPICZA ekspresyon vektörüne bağlanmış ve kompetent P. pastoris KM71H hücrelerine aktarılmıştır. Farklı konsantrasyonlarda zeosin içeren plakalardan otuz transformant seçilerek klonlar protein üretimi için test tüplerinde kültüre alınmıştır. Süpernatant örneklerinde glukanaz enzim aktivitesi ölçülmüş ve en yüksek glukanaz aktivitesi gösteren on klon belirlenmiştir. Ayrıca süpernatant örneklerindeki proteinler SDS-PAGE ile analiz edilmiş ve glukanaz enzimi, yaklaşık 34 ve 38 kDa olmak üzere 2 bant halinde gözlenmiştir. En yüksek glukanaz enzim üretimine sahip klon ile 200 mL indüksiyon ortamında (BMMY) 72 saat boyunca protein üretimi gerçekleştirilmiş ve rekombinant glukanaz enzimi Ni-NTA afinite kromatografisi ile saflaştırılmıştır. Saflaştırma işleminden sonra analiz edilen klonun 79,6 mg/L glukanaz üretim seviyesine ulaştığı belirlenmiştir. Saflaştırma işleminin her aşamasından alınan örneklerin SDS-PAGE analizi, süpernatant örneklerinde de gözlenmiş olan iki protein bandının glukanaz enzimini temsil ettiğini göstermiştir.

Anahtar Kelimeler

RDL Kalıcı Bağlantı (PID)
https://rdlopen.rawdatalibrary.net/r/ebyu/18553Resmi atıflarda kullanılan kalıcı adres
DOI
https://doi.org/10.18185/erzifbed.972627Yayıncı resmi DOI adresi
Tam Kayıt
AlanDeğerDil
dc.contributor.authorKARAOĞLAN, Mert
dc.contributor.authorKaraoğlan, Fidan Erden
dc.date.accessioned2026-10-18T20:56:37.795718423Z
dc.date.available2026-10-18T20:56:37.795718423Z
dc.date.issued2021
dc.description.abstractBu çalışmada, Rhizomucor miehei -1,3-1,4-glukanaz geni, Pichia pastoris ekspresyon sisteminde AOX1 promotorunun regülasyonu altında ifade edilmiş ve en yüksek üretim seviyesini sağlayan klon belirlenmiştir. Kodon optimize edilmiş gen, pPICZA ekspresyon vektörüne bağlanmış ve kompetent P. pastoris KM71H hücrelerine aktarılmıştır. Farklı konsantrasyonlarda zeosin içeren plakalardan otuz transformant seçilerek klonlar protein üretimi için test tüplerinde kültüre alınmıştır. Süpernatant örneklerinde glukanaz enzim aktivitesi ölçülmüş ve en yüksek glukanaz aktivitesi gösteren on klon belirlenmiştir. Ayrıca süpernatant örneklerindeki proteinler SDS-PAGE ile analiz edilmiş ve glukanaz enzimi, yaklaşık 34 ve 38 kDa olmak üzere 2 bant halinde gözlenmiştir. En yüksek glukanaz enzim üretimine sahip klon ile 200 mL indüksiyon ortamında (BMMY) 72 saat boyunca protein üretimi gerçekleştirilmiş ve rekombinant glukanaz enzimi Ni-NTA afinite kromatografisi ile saflaştırılmıştır. Saflaştırma işleminden sonra analiz edilen klonun 79,6 mg/L glukanaz üretim seviyesine ulaştığı belirlenmiştir. Saflaştırma işleminin her aşamasından alınan örneklerin SDS-PAGE analizi, süpernatant örneklerinde de gözlenmiş olan iki protein bandının glukanaz enzimini temsil ettiğini göstermiştir.
dc.identifier.doi10.18185/erzifbed.972627
dc.identifier.eissn2149-4584
dc.identifier.endpage630
dc.identifier.issn1307-9085
dc.identifier.issue2
dc.identifier.startpage620
dc.identifier.urihttps://rdlopen.rawdatalibrary.net/r/ebyu/18553
dc.identifier.volume14
dc.language.isoen
dc.relation.ispartofErzincan Üniversitesi Fen Bilimleri Enstitüsü Dergisi
dc.rightsinfo:eu-repo/semantics/openAccess
dc.subjectBiyoloji
dc.subjectBiyoteknoloji ve Uygulamalı Mikrobiyoloji
dc.titleΒ-glukanaz Enziminin Pichia pastoris Ekspresyon Sisteminde Hücre Dışı Üretimi ve Saflaştırılması
dc.typeArticle
dspace.entity.typePublication
rdl.citation.trdizin2
rdl.departmentERZİNCAN BİNALİ YILDIRIM ÜNİVERSİTESİ
rdl.source.indexTRDIZIN