Yazarlar
- Osma, Etem(20)
- Yangılar, Filiz(17)
- Kaya, Ozkan(16)
- Katipoğlu, Okan Mert(15)
- Yangilar, Filiz(15)
- Yildirim, Nalan(15)
- Karakus, Sinem(14)
- Turan, Metin(13)
- Özyürek, Selçuk(13)
- Elveren, Müjgan(12)
- Kandemir, Ali(12)
- Agar, Guleray(9)
- Bulut, Hüseyin(9)
- Ozturk, Halil Ibrahim(9)
- Varol, Tuğçe(8)
- Öztürk, Halil İbrahim(8)
- Haliloğlu, Kamil(7)
- Kılıç, Engin(7)
- Mutlu, Salih(7)
- Yildiz, Faruk(7)
- Akşit, Zeynep(6)
- Cebi, Kadir(6)
- Ertugay, Mustafa Fatih(6)
- Karakaya, Songül(6)
- Kiliçgün, Hasan(6)
- Kumbasaroglu, Hediye(6)
- Köksal, Ekrem(6)
- Türkoğlu, Aras(6)
- Yuca, Hafize(6)
- Achite, Mohammed(5)
- Akşit, Hüseyin(5)
- Atici, Ökkeş(5)
- Demirci, Betül(5)
- Poczai, Peter(5)
- Türkyılmaz, Doğan(5)
- Çebi, Kadir(5)
- Özkan, Güller(5)
- Öztürk, Halil Ibrahim(5)
- Aydın, Bilge(4)
- Bozkurt, Abdurrahim(4)
Yayınlar
- ArticleAçık Erişim2024Some animal protein antigens identified in cells of two plant species
Sahin, İbrahim; Eroksuz, Yesari; Ugur, Kader; İncili, Canan Akdeniz; Eroksuz, Hatice; Aydin, Gizem Nur; Ozpolat, Emine; Bildirici, Furkan; Aydin, Suleyman
Objectives: It has been recently reported that immune activity of some animal peptides/proteins has been found in some plants. In this study, the presence of immune reactivity of alarin, asprosin, paraoxonase, elabela, glucagon, and nesfatin-1 like molecules was investigated in two plant species related to Kastamonu Taşköprü garlic (an endemic cultivar of the Allium sativum L.) and Tunceli garlic (Allium tuncelianum). Methods: Ten Kastamonu and 10 Tunceli garlic were embedded in paraffin blocks and 4–5 μm transversal and longitudinal sections were taken and stained by immunohistochemical method. In addition, 500 mg of wet tissue samples were homogenized from these garlic and supernatants were obtained. The amounts of alarin, asprosin, elabela, glucagon and nesfatin-1 were studied by enzyme linked immunosorbent assay (ELISA) method and paraoxonase was studied by spectrophotometric method. Results: Studied molecules show immune reactivity in the cytoplasm of the bulb storage cells of the plants parenchyma. The ELISA supernatant results also confirmed the presence of these animal molecules in the plants. Conclusions: Although we cannot reveal the purpose of the presence of these animal molecules detected in plants with these existing data, we predict that these data will be a source of inspiration in the field of botany, that studies will shift in this direction and that they might contribute to the revision of the evolutionary processes of all living things, especially an ancestor of garlics.
RDL Kalıcı Kaydıİncele - ArticleAçık Erişim2024Advanced long-term actual evapotranspiration estimation in humid climates for 1958–2021 based on machine learning models enhanced by the RReliefF algorithm
Elbeltagi, Ahmed; Heddam, Salim; Katipoğlu, Okan Mert; Alsumaiei, Abdullah A.; Al-Mukhtar, Mustafa
Study region: Chengdu, Wuhan, Chongqing, and Kunming regions in China. Study focus: Accurate estimation of crop water use or actual evapotranspiration (AET) remains a key obstacle in the effective design of irrigation schedules, plans, and design. This is due to the non-linear nature of this phenomenon. To address this issue and guarantee more accurate ET predictions, this study attempts the following: i) to assess the performance of five machine learning (ML) models optimized by the RReliefF algorithm in estimating actual ET values for each month in four Chinese provinces under various agroclimatic conditions; and ii) to select the optimal model based on statistical metrics while minimizing discrepancies between the estimated and actual ET values. AET was estimated using support vector machine (SVM), ensemble bagged and boosted trees, robust linear regression (RLR), and Matern 5/2 Gaussian process regression (M-GPR) models. New hydrological insights for the region: The M-GPR model outperformed the other models and generated the best values for all statistical measures for training and testing stages: R2 (0.979, 0.982), RMSE (5.56, 5.09), MAE (3.29,3.16). In comparison, the RLR model exhibited the lowest training and testing performances metrics. The results of this study demonstrate the capacity of the M-GPR model to accurately predict long-term AET values. This model is best suited for further research on AET prediction at the stations under investigation, which could improve irrigation and boost agricultural productivity.
RDL Kalıcı Kaydıİncele - ArticleAçık Erişim2024EVALUATION OF DROUGHT STRESS IN WHEAT (Triticum aestivum L.) EXPOSED TO DROUGHT IN DIFFERENT PERIODS WITHIN THE PERSPECTIVE OF RETROTRANSPOSON-BASED GENETIC REGULATION AND ENZYMES
Bulut, Hüseyin
Drought is a significant factor in plant development and crop productivity. Therefore, this study focuses on investigating the impact of drought stress, which is particularly critical for Wheat (Triticum aestivum L.), the most important staple food for the global population. The study is designed to assess the extent of drought stress experienced by wheat during its growth stages and the importance of increasing soil water retention capacity to mitigate the stress caused by existing drought conditions. In the study, the first group of germinated wheat seedlings was subjected to drought stress during three different stages: seedling, growth, and filling periods. The other group of wheat seedlings received the addition of Natural Aquatic organic supplement to enhance soil water retention capacity and was subjected to the same drought stress conditions. At the end of the process, samples obtained from the applications were compared with control group samples grown without exposure to drought stress, in terms of their genetic stability and changes in antioxidant enzyme levels. The results of the Inter Retrotransposon Amplified Polymorphism marker analysis indicated that drought stress induces retrotransposon mobility, thereby affecting the genetic stability of wheat. Particularly, it was found that drought stress during the seedling stage is more effective compared to stress experienced in subsequent stages. Analysis results also revealed that drought stress alters the levels of Superoxide Dismutase, Catalase, and Malondialdehyde, with early-stage drought showing a more pronounced effect. Comparing the values of polymorphisms caused by retrotransposon mobility and genetic stability values between wheat samples exposed only to drought stress and those supplemented with Natural Aquatic organic addition to increase soil water retention capacity, it was evident that the addition mitigated drought stress. This was further supported by changes in Superoxide Dismutase, Catalase, and Malondialdehyde values. The study concluded that increasing soil water retention capacity or early-stage irrigation contributes to plant development and stability.
RDL Kalıcı Kaydıİncele - ArticleAçık Erişim2024Sucuk, Turkish-Style Fermented Sausage: Evaluation of the Effect of Bioprotective Starter Cultures on Its Microbiological, Physicochemical, and Chemical Properties
Yilmaz Topcam, Mahide Muge; Arslan, Betul; Soyer, Ayla
Bio-protection is one of the most popular natural protection methods to control food safety and shelf life. Lactic acid bacteria, especially Lactobacilli strains, are used in the food industry for this purpose due to their probiotic properties and, accordingly, bioprotective properties. We aimed to investigate the role of the bacteriocin-producing lactic acid bacteria Lactobacillus sakei and Pediococcus acidilactici in inducing microbiological, physicochemical, and chemical changes in the Turkish-style fermented sausage sucuk. The effects of protective cultures were compared with those of commercial starter cultures consisting of Pediococcus pentosaceus + Staphylococcus carnosus; a non-cultured group was used as a control. L. sakei inoculation and, to a lower extent, P. acidilactici inoculation resulted in the rapid domination of lactic acid bacteria (LAB) in the environment, whereas commercially used starter cultures and the non-cultured group showed lower counts of LAB. Moreover, L. sakei and P. acidilactici succeeded in inhibiting pathogens including S. aureus, E. coli, and Enterobacteriaceae. The number of enterococci decreased notably in the L. sakei-inoculated sucuk samples; however, an increase was determined in the samples inoculated with P. acidilactici. On the other side, the effect of commercial starter cultures was not sufficient for the inhibition of food-borne pathogens in the sucuk samples. Consequently, the inoculation of protective cultures, particularly of L. sakei, can provide a considerable contribution to improving microbial quality and food safety, retarding lipid oxidation, and increasing proteolytic activities in sucuk without important changes in its sensory properties.
RDL Kalıcı Kaydıİncele - ArticleAçık Erişim2024Microwave drying of black rosehip (Rosa pimpinellifolia L.) fruit: optimization for enhanced anthocyanin content and analysis of physicochemical properties and bioaccessibility
Pashazadeh, Hojjat; Ali Redha, Ali; Johnson, Joel B.; Koca, Ilkay; Ertugay, Mustafa Fatih
Black rosehip (Rosa pimpinellifolia L.) fruit is a rich source of anthocyanins and has been promoted for several bioactive properties. Drying this fruit can increase its shelf life and enhance its applications in functional food products. This study aimed to optimize the microwave drying process of black rosehip fruit. The process was optimized based on the effect of microwave power (300, 500, and 650 W) and the amount of sample per batch (50, 75, and 100 g) on the amount of total anthocyanins and individual anthocyanins (cyanin chloride, cyanidin-3-glucoside, cyanidin-3-rutinoside, pelargonidin-3-glucoside, and cyanidin chloride). The effect of different drying conditions on color, microstructure, and texture was also investigated. The bioaccessibility of anthocyanins from the dried food sample at optimum conditions was assessed by in vitro gastrointestinal digestion. The results showed that microwave power and the amount of sample had a significant effect on the anthocyanin content of black rosehip fruit. The optimum conditions were determined to be 350 W power and 50 g sample mass. Lower microwave power and less sample mass produced dried fruits which were slightly darker, less red and less yellow. The hardness of dried fruit was also significantly affected by the microwave drying conditions. The dried black rosehip at optimum conditions showed a high bioaccessibility of cyanidin-3-glucoside (82.6 ±4.1%) which is known for a wide range of bioactive properties.
RDL Kalıcı Kaydıİncele - ArticleYalnız künye2024Modeling of irrigation water quality parameter (sodium adsorption ratio) using hybrid swarm intelligence-based neural networks in a semi-arid environment at SMBA dam, Algeria
Achite, Mohammed; Katipoğlu, Okan Mert; Elshaboury, Nehal; Kartal, Veysi; Aktürk, Gaye; Ertugay, Neşe
Sodium adsorption rate (SAR), which significantly affects soil and plant health, is determined according to the concentration of sodium ions, calcium, and magnesium in irrigation water. Accurate estimation of SAR values is vital for agricultural production and irrigation. In this study, hybrid swarm intelligence-based neural networks are used to model sodium adsorption ratio in irrigation water quality parameters in a semi-arid environment at Sidi M’Hamed Ben Aouda (SMBA) dam, Algeria. For this, the nature-inspired optimization techniques of particle swarm optimization (PSO), genetic algorithm (GA), Jaya algorithm (JA), artificial bee colony (ABC), and firefly algorithm (FFA) and the signal processing technique of variational mode decomposition (VMD) have been combined with artificial neural networks (ANN). Correlation matrices were used to select the data entry structure in the established models. Water quality parameters with a statistically significant and medium to high relationship with SAR values were presented as input to the model. The overall performance was measured using various statistical metrics, scatter diagrams, Taylor diagrams, correlograms, boxplots, and line plots. In addition, the effect of input parameters on model estimation was evaluated according to Sobol sensitivity analysis. As a result, the GA-ANN algorithm demonstrated superior performance (MSE = 0.073, MAE = 0.193, MAPE = 0.048, MBE=-0.16, R2 = 0.934, WI = 0.968, and KGE = 0.866) based on the statistical indicators, indicating better results compared to other models. The second-best model, ABC-ANN (MSE = 0.084, MAE = 0.233, MAPE = 0.066, MBE=-0.135, R2 = 0.897, WI = 0.965, and KGE = 0.920) was also selected. The weakest prediction outputs were obtained from the VMD-ANN model. The accurate and reliable estimation of SAR in irrigation water has the potential to facilitate improvements in agricultural irrigation management and agricultural production efficiency for farmers, agricultural practitioners, and policymakers.
RDL Kalıcı Kaydıİncele - ArticleAçık Erişim2024Plasma and Milk Pharmacokinetics and Estimated Milk Withdrawal Time of Tolfenamic Acid in Lactating Sheep
Corum, Orhan; Uney, Kamil; Coskun, Devran; Durna Corum, Duygu; Cetin, Gul; Elmas, Muammer
Objective: This study aimed to investigate the plasma and milk pharmacokinetics, as well as the withdrawal time (WT) from milk of tolfenamic acid (2 and 4 mg/kg) following intravenous (IV) administration to eight healthy lactating Akkaraman sheep. Methods: The trial was conducted in two periods in accordance with a crossover pharmacokinetic design. The concentrations of tolfenamic acid in the plasma and milk were determined using high-pressure liquid chromatography and evaluated using non-compartmental analysis. The WT of tolfenamic acid in milk was calculated using the WT 1.4 software. Results: Compared to the 2 mg/kg dose, plasma volume of distribution at steady state (from 0.43 to 0.50 L/kg), terminal elimination half-life (from 2.41 to 4.14 h) and dose-normalized area under the plasma concentration–time curve (AUC0−∞, from 9.46 to 30.11 h µg/mL) increased, whereas total body clearance (from 0.21 to 0.13 L/h/kg) decreased at the 4 mg/kg dose. The peak milk concentration (Cmax) and AUC0−∞ values in milk were 0.26 µg/mL and 0.28 h µg/mL, respectively, for 2 mg/kg, and 0.43 µg/mL and 0.55 h µg/mL, respectively, for 4 mg/kg. Although the dose-normalized Cmax of milk decreased depending on the dose, no difference was observed in dose-normalized AUC0−∞. The AUC0−∞ milk/AUC0−∞ plasma ratio was 0.03 for 2 mg/kg and 0.02 for 4 mg/kg. The WT values calculated for milk at dosages of 2 and 4 mg/kg were 3 and 4 h, respectively. Conclusions: A decrease in plasma elimination and an increase in plasma concentration of tolfenamic acid were observed depending on the dose. Tolfenamic acid lowly passed into sheep's milk at 2 and 4 mg/kg doses. This study may provide valuable information for clinicians’ decision-making processes.
RDL Kalıcı Kaydıİncele - ArticleAçık Erişim2024Understanding the impact of essential oils on grape metabolism and pathogen resistance: a study with a focus on Botrytis cinerea
Kaya, Ozkan; Karakus, Sinem; Bozkurt, Abdurrahim; Yilmaz, Turhan; Hajizadeh, Hanifeh Seyed; Turan, Metin
Background: The exploration of EOs and their impact on primary metabolites in agricultural products, such as grapes, holds significant importance in the post-harvest preservation and enhancement of berry quality. Therefore, our research aimed to dissect the effects of various EO treatments on the biochemical composition of grapes, specifically examining alterations in sugar, organic acid, and amino acid levels. Results: Our findings highlighted that the OF treatment, a combination of Eugenol and Botrytis cinerea, significantly escalated sugar content, with remarkable increases in sucrose, glucose, and fructose compared to the control group. The SF treatment led to the highest levels of certain organic acids, including tartaric, butyric, and malonic acids, whereas the TO treatment prominently augmented amino acids such as tyrosine and phenylalanine. Utilizing PCA, our study effectively captured the variability within the treatment dataset, revealing distinct clusters of treatments and their correlations with specific metabolites. The PCA biplot underscored the influence of treatments on metabolic profile of grape berries, with treatments like OSF, TO, and TOSF demonstrating close associations with specific amino acids, suggesting positive correlations. Conclusion: Our current results indicate that EOs substantial influence on the metabolic profile of grapes, resulting in enhanced fruit quality and extended shelf life. Variations in sugar, organic acid, and amino acid levels among different EO treatments highlight their potential for improving post-harvest characteristics. To sum up, these findings are valuable for the agricultural and food industries, showcasing the utility of EOs as natural preservatives and enhancers in fruit cultivation and storage. Graphical Abstract: (Figure presented.)
RDL Kalıcı Kaydıİncele - ArticleAçık Erişim2023Erzincan İlindeki Tüketicilerin Tulum Peyniri Tüketim Tercihlerinin İncelenmesi
Kumbasaroglu, Hediye
Bu çalışmanın amacı Erzincan’da ikamet eden tüketicilerin coğrafi işaret ile etiketlenmiş olan Erzincan tulum peyniri tüketim tercihlerini etkileyen faktörleri belirlemektir. Araştırmada Erzincan ilinde ikamet eden 271 tüketiciyle yüz-yüze görüşmeler yapılmıştır. Toplanan datalar tanımlayıcı istatistikler ve frekans tablolarının oluşturulmasında kullanılmıştır. Tulum peyniri tüketimini etkileyen faktörler, çok değişkenli lineer regresyon analizi ile tespit edilmiştir. Bağımlı değişken olan tulum peyniri tüketim miktarını, köyde yaşayan tanıdıkların olması, ailenin ortalama geliri, ailenin ortalama aylık harcaması, beyaz peynir tüketim sıklığı, kaşar peynir tüketim sıklığı, beyaz peynir tüketim miktarı, kaşar peynir tüketim miktarı, tulum peynirinin fiyatı, tulum peynirinin salamura olması, tulum peynirinin coğrafi işaretli ürün olması ve tulum peyniri satış noktası gibi parametrelerin etkilediği sonucuna varılmıştır. Oluşturulan modelin, tulum peyniri tüketimindeki değişkenlerin açıklanma oranı %77.50 seviyesinde olup varyans analizi (ANOVA) çözümüne göre anlamlı olduğu belirlenmiştir. Sonuçta tulum peyniri için ürün hakkında bilgilendirici çalışmaların yapılması ve sağlık açısından faydalarının anlatılması ile tüketim miktarının artışına katkı sağlayacağı önerilmektedir
RDL Kalıcı Kaydıİncele - ArticleAçık Erişim2023Effect of Microbial Fertilizer on The Development of Pepper (Capsicum annuum L.) Seedlings Exposed to Salt Stress
Dursun, Atilla; Ozturk, Halil Ibrahim
Salinity is an important abiotic stress factor that negatively affects plant growth and yield. The study, the effect of microbial fertilizer containing Bacillus subtilis bacteria, commercially named Subtima, on salt stress in pepper was observed. Two different saline solutions (100 mM and 200 mM) were prepared to create salt stress in the plant growing medium. The fertilizer solution was applied to the plants in 4 different concentrations (300, 400, 500 and 600 ppm) from the leaves in the form of a spray. Morphological parameters such as plant height, stem length, leaf length, leaf width, and petiole length were measured. It was found that salt stress resulted in a decrease in plant morphological characteristics compared to the control group (0 mM salt + 0 ppm fertilizer). It was found that the most effective fertilizer dose to increase plant height (25.23 cm) at 100 mM salt stress was 400 ppm. At 200 mM salt stress, it was found that the most effective fertilizer dose for increasing plant height (22.67 cm) was an application of 300 ppm application. In general, fertilizer applications were found to be effective in reducing the negative effects of salt on the morphological traits studied.
RDL Kalıcı Kaydıİncele - ArticleAçık Erişim2023Domates Yetiştiriciliğinde Tuz Stresinin Olumsuz Etkilerine Karşı Kitosan Uygulaması
Bulut, Hüseyin; Ozturk, Halil Ibrahim
Küresel düzeyde meydana gelen iklim değişiklikleri, savaşlar, nüfus artışı, tarım arazilerindeki azalma gibi nedenlere toprak tuzluluğu da eklenince üretim verimliliği giderek önem kazanmıştır. Tuzluluk bitki gelişmesini önemli derecede etkilemektedir. Bundan dolayı bu konuda çalışmalar yoğunlaşmıştır. Bitki gelişimini tuz stresinden korumak için organik çözümlere odaklanılmıştır. Bu çalışmada domates fidelerinde tuz stresini hafifletmek için kitosan biyopolimeri uygulanmıştır. Tuz stresine karşı bitki savunma refleksleri Süperoksit Dismutaz (SOD), Katalaz (CAT) ve Malondialdehit (MDA) enzim seviyelerindeki değişim ile incelenmiştir. Tuz stresi için uygulanan kitosanın anlamlı derecede SOD, CAT ve MDA enzim seviyelerini etkilediği tespit edilmiştir. Kitosanın abiyotik streslerden korunmak için kullanışlı ve makul bir araç olduğu ifade edilebilir. Ayrıca enzim değerlerinin bitkilerde strese neden olan etkenlerin tespitinde ve bitkisel yanıt mekanizmalarının aydınlatılmasında kullanışlı olduğu belirlenmiştir.
RDL Kalıcı Kaydıİncele - ArticleAçık Erişim2023Doğu Anadolu Bölgesinde (Türkiye) Yayılış Gösteren Scrophularia erzincanica ve Scrophularia fatmae (Scrophulariaceae) Popülasyonlarının Genetik Çeşitlilik Analizleri
Kandemir, Ali; Kılıç, Engin; Yildiz, Faruk; Türkoğlu, Halil İbrahim; Yildirim, Nalan
Scrophularia fatmae Kandemir & İlhan ve Scrophularia erzincanica R.R. Mill (Scrophulariaceae) Erzincan/Türkiye'ye özgü endemik türlerdir. S. erzincanica ve S. fatmae'de ki IUCN kategorileri sırasıyla EN ve CR'dir. Bu çalışmada, ISSR belirteçlerini kullanarak Erzincan'daki üç S. erzincanica popülasyonunun ve iki S. fatmae popülasyonunun genetik varyasyon seviyelerini ve genetik yapısı araştırılmıştır. Bu amaçla 10 primer, 75 bireyden oluşan beş popülasyondan 104'ü (%89.6) polimorfik olmak üzere toplam 116 bandı amplifiye edildi. UPGMA küme analizi, genetik varyasyonlar ve coğrafi mesafeler arasında anlamlı bir ilişki olduğunu göstermiştir. Alpin bölgesine uyum sağlamış olan S. fatmae'nin yayılış alanı ve populasyon büyüklüğü daha küçüktür. Ek olarak, S. fatmae'nin kendi kendine tozlaşma eğilimi daha yüksektir. S. erzincanica daha büyük bir popülasyona sahiptir. S. erzincanica ve S. fatmae'de etkili tozlayıcı sayısı sırasıyla üç ve birdir. Bu sebeplerin de katkısı ve araştırma sonuçlarına göre S. fatmae ve S. erzincanica türleri karşılaştırıldığında S. erzincanica'da genetik çeşitliliğin daha fazla olduğu görülmektedir. Bu çalışma sonucunda elde edilen genetik veriler, S. erzincanica ve S. fatmae türlerinin yanı sıra diğer nadir ve tehlike altındaki bitki türleri için koruma stratejilerinin geliştirilmesinde kullanılabilir.
RDL Kalıcı Kaydıİncele - ArticleAçık Erişim2023Ergan Dağı’nın Farklı Yükseltilerinde Yaygın Olarak Yetişen Bitkilerde Ağır Metal (Ba, Cd, Co, Cr, Pb) Birikiminin Belirlenmesi
Elverici, Mert; Kandemir, Ali; Kılıç, Engin; Osma, Etem; Varol, Tuğçe; Yildiz, Faruk; Türkoğlu, Halil İbrahim; Hasbenli, Abdullah; Kiymaz, Muhammet Onur; Akverdi, Aysel
Bu çalışma, Erzincan il sınırları içerisinde yer alan Ergan Dağı’nın farklı yüksekliklerinde yetişen yaygın 30 bitki türü ile yapılmıştır. Çalışma kapsamında 1500 m, 2000 m, 2500 m ve 3000 m olmak üzere farklı yüksekliklerden toplanan bitkilerde ve yetiştikleri topraklarda metal (Cd, Cr, Pb, Co, Ba) konsantrasyonları tespit edilmiştir. Toplanan bitkilerin çiçek, yaprak ve kök ile yetiştikleri topraklar laboratuvarda ön işlemlerden geçirilmiştir. Hazır hale getirilen örneklerde metal konsantrasyonları ICP-MS’te analizi gerçekleştirilmiştir. Elde edilen bitki ve toprağa ait metal verileri istatistiksel olarak değerlendirilerek, her bir metal için rakımlar arasındaki farklılıklar belirlenmiştir. Çalışmada Cd ve Pb konsantrasyonunun 2500 m yetişen bitkilerde ve topraklarda yüksek olduğu belirlenmiştir. İlave olarak, Turanecio hypochionaeus ve Crepis armena türlerinin bünyesinde kadmiyum metalini toprağa göre daha fazla biriktirdiği ve bazı türlerin biyomonitor özelliğe sahip olduğu anlaşılmıştır.
RDL Kalıcı Kaydıİncele - ArticleAçık Erişim2023Domates (Solanum lycopersicum L.)’te Fungisit Stresine Karşı Kitosanın Etkisi
Bulut, Hüseyin; Ozturk, Halil Ibrahim
Domates içerdiği besin değerleri, kullanım miktarı ve çeşidi bakımından insanlar için önemli bir besin ögesidir. Domates yetiştiriciliğinde verim kayıplarına neden olan önemli faktörlerden birisi mantar hastalıklarıdır. Bu hastalıklarla mücadelede en hızlı ve etkili çözüm olarak fungisitler kullanılmaktadır. Ancak fungisitlerin kullanımı sonucu oluşan stres ve olası toksik riskler besin zincirini etkilemektedir. Çalışmamızda fungisitin olumsuz etkileri ve buna karşı kitosanın bitki yetiştiriciliğinde stresi azaltmak için kullanımı incelendi. % 80 Mancozeb aktif madde içeren fungisitin domateste oluşturduğu stresin düzeyi, kitosanın etkileri SOD, CAT ve MDA ekspresyonlarındaki değişimleri tek hücre jel elektroforezi ve DNA üzerindeki hasarı değerlendirildi. Çalışma sonucunda uygulanan fungisitin domates fidelerinde strese, SOD, CAT ve MDA enzim değerlerinde değişime neden olduğu tespit edildi. Fungisitin comet assay analizinde DNA ipliklerinde kırılma sonucu oluşan kuyruk uzunluğu ve kuyruk DNA % değerinde artışa neden olduğu belirlendi. Uygulanan kitosanın enzim değerlerinde ve DNA hasarına karşı bazı dozlarda (100 ppm ve 150 ppm) olumlu etkisinin olduğu gözlendi. Kitosan bitkilerde stres etkenlerine karşı savunma mekanizmasını desteklemek için kullanılabilir.
RDL Kalıcı Kaydıİncele - ArticleAçık Erişim2023CHEMICAL COMPOSITION AND ANTIFUNGAL ACTIVITY OF Origanum acutidens ESSENTIAL OIL AGAINST Sclerotinia sclerotiorum (Lib.) DE BARY AND Phytophthora infestans (Mont.) DE BARY
Bayar, Yusuf; Şimşek, Samed; Akşit, Zeynep; Kandemir, Ali
The aim of this study was to investigate the chemical components and evaluate the antifungal activity of Origanum acutidens essential oil. The aerial parts of O. acutidens were collected, and the hydrodistillation method was used to extract the essential oil. Gas chromatography-mass spectrometry (GC-MS) analysis was performed to determine the chemical composition of the essential oil. The main components identified were α-terpineol (4.76%), p-cymene (7.6%), linalool (14.82%), and carvacrol (49.4%). The essential oils were tested against two pathogens in vitro experiments to evaluate their antifungal activity. Different concentrations of the essential oil were applied, and the inhibition of mycelial growth was measured. The results demonstrated that the essential oil exhibited antifungal properties against both pathogens. At a dose of 4.8 µL/Petri dish, the mycelial growth of both pathogens was completely inhibited. However, Sclerotinia sclerotiorum showed higher tolerance to the essential oil compared to Phytophthora infestans. Furthermore, a dose-effect study was conducted as a part of this research. The LC50 values (lethal concentration at which 50% of the pathogens' growth is inhibited) for P. infestans and S. sclerotiorum were calculated as 0.982 µL/Petri and 1.61 µL/Petri, respectively. The study concluded that the essential oil of O. acutidens has the potential to be a natural antifungal agent, particularly against S. sclerotiorum and P. infestans. However, further research is needed to investigate the mechanisms of action and explore potential applications of this essential oil in managing plant diseases.
RDL Kalıcı Kaydıİncele - ArticleAçık Erişim2023Farklı Habitatlarda (Jips, Kireçtaşı, Serpentin) Yetişen Bitkilerde Bazı Ağır Metallerin (Ba, Cd, Co, Cr, Pb) Konsantrasyonunun Belirlenmesi
Osma, Etem; Varol, Tuğçe; Elveren, Müjgan
Bu çalışmada, Erzincan il sınırları içerisinde farklı habitatlarda (jips, kireçtaşı, serpentin) yetişen 25 bitki türü Jips (Ebenus macrophylla Jaub and Spach., Gypsophila lepidioides Boiss., Linum flavum L., Onobrychis nitida Boiss., Paracaryum stenolophum Boiss., Psephellus recepii Wagenitz & Kandemir, Tanacetum heterotomum (Bornm.) Grierson, Verbascum alyssifolium Boiss.), kireçtaşı (Alkanna megacarpa DC., Alyssum sibiricum Willd., Anthemis sp., Astragalus sp., Chrysophthalmum montanum (DC.) Boiss, Ebenus laguroides Boiss., Genista aucheri Boiss., Pelargonium endlicherianum Fenzl., Stachys sparsipilosa R.Bhattacharjee & Hub-Mor.) serpantin (Artedia squamata L., Consolida sp., Convolvulus pseudoscammania C. Koch., Erysimum pulchellum Willd., Fumana aciphylla Boiss., Gladiolus halophilus Boiss.& Heldr., Hypericum thymbrifolium Boiss & Noé, Salvia indica L.) ile çalışılmıştır. Çalışma kapsamında farklı bitkilerde ve yetiştikleri topraklarda metal (Cd, Cr, Pb, Co, Ba) konsantrasyonları belirlenmiştir. Toplanan bitkilerin çiçek, yaprak ve kök kısımları ile yetiştikleri habitatların toprakları laboratuvarda ön işlemlerden geçirilmiştir. Sonrasında hazırlanan örneklerde metal konsantrasyonu ICP-MS’ te analiz edilmiştir. Elde edilen bitki ve toprak verileri istatistiksel olarak değerlendirilerek, habitatlar arasındaki farklılıklar belirlenmiştir. Bitkinin generatif ve vegetatif kısımlarında metal bakımından farklılıklar olduğu tespit edilmiştir.
RDL Kalıcı Kaydıİncele - ArticleAçık Erişim2023Biyoloji Öğretimi: Öğretim Programları Biyoloji Kazanımlarının İncelenmesi
Taşçi, Güntay
Yapılan çalışmanın amacı biyoloji öğretimi için önemli olan öğretim programlarının incelenmesidir. Çalışma nitel araştırma kapsamında gerçekleştirilmiş, öğretim programlarının içerik analizine başvurulmuştur. Öğretim programlarındaki biyoloji üniteleri, kavram sayıları ve kazanımlar incelenmiştir. Kazanımların incelenmesinde Yenilenmiş Bloom Taksonomisi (YBT) kullanılmıştır. Kodlama sürecinde kodlayıcılar arası uzlaşma ve uyum indeksleri hesaplanmıştır. Analiz sonuçları biyoloji kazanımlarının tüm eğitim basamaklarında olgusal ve kavramsal bilgiyi anlama basamağında birikim gösterdikleri, üst düzey düşünme becerilerine yönelik kazanımların sınıf ya da ünite düzeylerinde dengeli dağılmadıklarını göstermiştir. Bunlar ile uyumlu olarak kavram yoğunluğunun tüm eğitim düzeylerinde yüksek olduğu görülmüştür. Öğretim programlarındaki biyoloji konu alanının ünitelere ayrılmasında ortaokul (5-8) ve ortaöğretim (9-12) programları sarmallık bakımından birbirlerini desteklerken ilkokul (3-4) düzeyinde konu alanı içeriklerinin desteklenebileceği anlaşılmıştır.
RDL Kalıcı Kaydıİncele - ArticleAçık Erişim2023Erzincan ve çevresinde yayılış gösteren Astragalus L. türlerinin genetik çeşitliliğinin ISSR yöntemi ile belirlenmesi
Yildirim, Nalan; Dağ, Engin; Korkmaz, Mustafa
Bu çalışmada, 2021 yılının vejetasyon döneminde Erzincan’daki 42 farklı lokaliteden Astragalus L. cinsine ait bitki örnekleri toplanmıştır. Yapılan bitki tayini çalışmaları sonucunda 12 takson (A. pennatulus, A. compactus, A. aduncus, A. xylobasis, A. angustifolius subsp. angustifolius, A. karamasicus,A. kurdicus, A. cancellatus, A. eriocephalus subsp. eriocephalus, A. lycius, A. microcephalus, A. lagurus) belirlenmiştir. Bunlardan 3’ü (Astragalus pennatulus, Astragalus karamasicus, Astragalus lycius) endemiktir. Belirlenen türler arasındaki genetik ilişkiler ISSR moleküler markırları ile araştırılmıştır. ISSR (kısa dizi tekrarları arası) yönteminde 16 primer (UBC868, UBC817, UBC807, UBC812, UBC816, UBC825, UBC824, UBC830, UBC836, UBC840, UBC848, UBC855, UBS856, UBC841, UBC842, UBC61) kullanılmıştır. PCR sonuçlarına gore, çalışılan primerler 100-2000 bç uzunluğunda bantlar vermiştir. ISSR primerlerine göre polimorfizm % 90.8 hesaplanmıştır. ISSR verileri ile UPGMA yöntemi kullanılarak dendrogramlar oluşturulmuştur. En yüksek genetik benzerlik A. kurdicus ile A. angustifolius supsp angustifolius taksonları arasında gözlenirken, en düşük genetik benzerlik A. angustifolius subsp angustifolius ile A. pennatulus taksonları arasında gözlenmiştir. Çalışılan bu markerlar Astragalus türleri arasındaki genetik benzerliği karakterize etmede uygun markırlar olduğunu ortaya çıkarmıştır.
RDL Kalıcı Kaydıİncele - ArticleAçık Erişim2023Sporcularda Kaslı Olma Dürtüsü ve Yeme Tutumu ile İlişkisinin Değerlendirilmesi
Fidan, Murat; Eskici, Günay; Yarar, Hakan; Karahan, Sevil; Saraç, Osman Emir
Yapılan bu çalışmanın amacı; kaslı olma dürtüsü (KOD) ve yeme tutumu ilişkisinin incelenmesidir. Çalışmaya çeşitli spor branşlarında aktif olarak spor yapan gönüllü 397 erkek sporcu katılmıştır. Çalışmada kapsamında verileri elde etmek amacıyla “Kaslı Olma Dürtüsü Ölçeği ve “Yeme Tutumu Testi (YTT-40)” kullanılmıştır. Sporcuların KOD toplam ve alt boyutlarından (Kaslı Olmaya Yönelik Tutumlar (KOYT), Kaslı Olmaya Yönelik Antrenman Davranışları (KOYAD), Kaslı Olmaya Yönelik Yeme ve Takviye Kullanımı, KOYYTK) elde edilen puanların ortalaması sırasıyla 41,9±12,6, 22,1±7,7, 11,3±4,3, 8,5±3,9 ve YTT-40 puan ortalaması ise 16,5±10,4 bulunmuştur. KOD toplam puanının KOYAD (0.382) ve KOYYTK (0.336) ile orta düzeyde; YTT-40 (0.162) ile zayıf düzeyde ve spor yapılan süre (0.347) ile negatif zayıf yönde ilişkiye sahip olduğu, YTT-40 puanının KOYAD (0.356) ile orta düzeyde; KOYT (0.267), KOD (0.162) ve KOYYTK (0.148) ile zayıf düzeyde istatistiksel olarak anlamlı ilişkiye sahip olduğu belirlenmiştir. Sporcuların eğitim düzeyi ile KOYT, KOD toplam ve YTT-40 toplam puan ortalamaları arasında anlamlı ilişki olduğu (p<0.05) ve farklılığı lise ve öncesi eğitim düzeyine sahip sporcuların oluşturduğu tespit edilmiştir. İlgilenilen spor branşı açısından KOYAD, KOYYTK ve YTT-40 toplam puan ortalamaları arasında anlamlı ilişki olduğu ve farklılığı kuvvet-güç sporcularının oluşturduğu belirlenmiştir. Sonuç olarak, sporcularda kaslı olma dürtüsünün orta düzeyde olduğu, bu farklılığın en çok kuvvet-güç sporcuları ile lise ve öncesi eğitim düzeyine sahip sporcularda olduğu belirlenmiştir. Kaslı olma dürtüsünün artması yeme bozukluğunu artırmaktadır.
RDL Kalıcı Kaydıİncele - ArticleAçık Erişim2023Healing Effect of Ascorbic Acid against Genetic and Epigenetic Changes Caused by Pendimethalin in Wheat
Yildirim, Nalan; Dartar, Muhammed Semih
Because of the increasing need for agricultural products in the world, the use of pesticides, which are used to increase yield, is increasing day by day. Herbicides constitute a large part of the total amount of pesticides used, such as 20%. It is known that herbicides have toxic effects and irreversibly disrupt DNA and gene expression. Pendimethalin is a widely used herbicide against weeds in the production of grains, legumes, and vegetables. Ascorbic acid has an antioxidant effect. Molecular markers are frequently used to determine genotoxic and mutagenic effects at the DNA level. It was aimed to determine the curative effect of ascorbic acid on the negative effects of pendimethalin. IRAP and ISSR molecular markers were used. It was found that the GTS ratio decreased as a result of increasing the dose of pendimethalin applied in wheat, resulting in DNA damage and the positive effect of applied ascorbic acid on DNA damage.
RDL Kalıcı Kaydıİncele
